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呼吸内科专业学位研究生“大数据”临床科研思维的培养

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中华肺部疾病杂志(电子版)2017 年 10 月第 10 卷第 5 期 ChinJLmisDKElectonicEditirai), Ontober2:)17, VollO,

•医学教育•

呼吸内科专业学位研究生“大数据”临床科研思维的培养

徐瑜1

刘煜亮2

李琦1

【关键词】呼吸内科;大数据;临床科研;专业学位研究生;物联网 中图法分类号:R37,R563

21世纪,随着互联网技术的发展,“云技术”对庞大数据 的存储、灵活调用以及“物联网”概念的普及,各种电子数据 增长速度不断加快,呈现出前所未有的“数据爆炸”,包括医 疗卫生领域在内的各个领域都被推到了一个“大数据(big

data)”时代⑴。在医疗卫生领域,对于患者的诊疗策略更加

需要基于“数据分析”而得出,而非传统的经验和直觉,临床 决策也逐渐过度到基于临床研究数据统计分析的循证医学

(evidence based medicine,EBM)时代⑵。利用“大数据,’进

行临床科研并指导临床诊疗将是目前发展的趋势。医疗卫 生领域的“大数据”是指包括因为临床或者科研需要收集起 来的有关健康或者诊疗的所有信息,其中的数据都是未加修 饰的“纯天然”数据,没有任何的排除纳人标准,反应的是群 体,意味着不仅仅是患者,还有健康人群的医疗卫生数据,具 有数据量大、数据种类多、价值高、价值密度低、产生快、处理 快的特点[3]。在大数据背景下,如何充分利用这些纷繁复杂 的“大数据”进行临床决策及科学研究是每个临床工作者的 机遇和挑战。

呼吸内科专业学位研究生是针对呼吸内科工作实际需 要培养的,具备呼吸内科临床、科研工作技能的高素质临床 工作者,偏重临床科研是呼吸内科专业学位研究生有别于科 研型研究生的重要特点,亦是专业学位研究生通过临床科研 提高临床实践能力的重要途径。将“大数据”思维与呼吸内 科专业学位研究生培养相结合,有利于提高专业学位研究生 临床科研能力及呼吸内科专业素养。导师和研究生应快速 面对这种改变和挑战,更新教和学的理念,推动专业学位研 究生科研能力培养的改革和发展。

一、利用“大数据”进行临床研究的必要性

在信息时代以前,由于采样的困难、计算机技术或者分 析手段的,通常无法收集每个个体的数据,只能在总体 (population)里进行抽样(sampling),通过分析这些样本,进 而推测总体的特征。这种思维模式产生了目前公认的临床 研究方法一随机对照试验(randomized controlled trail,RCT),

RCT的实质是通过随机采样,在一定的样本量针对特定影响

KOI: 10.3877/cma.j.issn.1674-6902.2017.05.038

作者单位:400037重庆,第三军医大学新桥医院呼吸内科1 400016重庆,重庆医科大学附属医院呼吸内科2

通信作者:李琉,Email:liqioliver@ sina.com

文献标识码:B

因素进行分析,以获得支撑研究结论的证据。但由于受技术 和经费,RCT采用的样本量有一定局限,在样本采集阶 段易受人为因素的干扰,同时,RCT过于强调“因果关系”,只 对既定影响因素进行分析,容易忽视或掩盖其他相关因素对 结果的影响。在大数据时代,我们往往通过各种医疗相关信 息系统把所有个体的各方面的信息都进行收集整合,逐渐形 成了基于大数据的临床研究(big-data clinical trail,BCT)[4]。

BCT方法可以避免RCT方法各环节产生的各种偏倚,同时

提高临床研究效率,也有助于找到原来未能发现的与疾病相 关的其他因素,得出意想不到的结论,甚至以往很多观 念,得到在“真实世界”中的研究结果(real world stuffy,

RWS)。2014 年欧洲临床肿瘤学会(European Societ),for Medical Oncology,ESMO)大会上,吴一龙教授报告ICAN临

床研究结果,ICAN研究是一项在真实世界进行的有关肺腺 癌全肺切除术后患者的前瞻性非干预性研究,结果表明根治 切除后的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC) 不能从术后辅助化疗中获益,这一结果与之前的IALT、

JBR10、GALGB9633、ANITA临床研究结果截然相反[5]。争

议集中在IB、高龄并合并症患者,这部分患者可能不能从术 后辅助化疗中获益。ANITA等研究对纳人人群的控制严格, 导致研究结果内部真实性高,外部真实性差。由此可见,采 用BCT的研究方法,利用纷繁复杂的数据,通过合适的数据 处理方法,去揭示一种或多种因素与疾病的内在相关性、模 式及发展趋势,能够补充RCT临床研究的不足,从而推动更 合理的诊断依据和治疗方法。

二、呼吸系统临床科研在“大数据”时代面临机遇与挑战整个医疗系统疾病的监测、诊疗、随访和预后判断已经 “大数据化”,通过电子病历、数据库、云存储终端产生的各种 类型的数据可作为进行临床科学研究的原始素材。已经有 一系列的平台和技术用于存储、分析医疗相关的大数据,使 基于大数据的临床科研成为可能[6]。呼吸系统与外界相通, 随着环境污染、烟草暴露、大气有毒有害物质增加,呼吸系统 疾病发病率逐年增高,致残率、致死率均位居前列。“大数 据”的临床研究方法为呼吸系统临床科研带来了机遇。

利用“大数据”方法进行呼吸系统慢性疾病研究具有以 下优势:①反映真实世界的研究。呼吸慢性疾病患者具有基 础疾病多,个体间基线差异大,用药复杂,多次住院治疗,干

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扰因素多等特点。在设计RCT试验时,一般选择某个阶段 的患者,通过严格的人组标准,并排除具有合并症的人群,限 定在很小的人群进行临床实验。慢性阻塞性肺疾病(chronic

obstructive pulmonary disease,C0PD)患者肺功能减低是一■个

整合不够,多种类型的临床数据分散在多个应用系统中,缺 少一个直接的以患者或疾病为索引的数据整合展示,因此, 在目前信息化水平上进行大数据研究仍存在较大挑战。

三、培养具备“大数据”思维能力的呼吸内科专业学位研究生

专业学位研究生是与学术型学位相对而言的,旨在为培 养专业技术人才,目的是让他们在具有扎实理论基础的同 时,还能更好地适应特定行业或职业的实际工作需要,使其 成为应用型高层次专门人才。呼吸内科专业学位,培养目标 是掌握医学领域基础理论和专业知识、具有较强的解决呼吸 动态变化并逐渐加重的过程,很多C0PD的RCT临床实验只 限定在中、重度或者急性加重的患者,很多早期、轻度肺功能 没有严重损害的C0PD患者被多数的临床RCT试验排除在 外,此外具有合并症C0PD患者往往亦被排除在某些RCT试 验以外。我国呼吸病学专家钟南山院士在2016年欧洲呼吸 学会年会(European Respiratory Society,,ERS)上呼吁 C0PD 的治疗战略要提前,对于早期无症状的患者使用支气管舒张 剂,提示C0PD作为一个慢性气流受限疾病,从起病初即应 该受到重视。采取大数据的研究方法,还原真实世界的研究 对于呼吸系统慢性疾病非常重要;②强调主动采集、上传数 据。基于“物联网”的数据采集系统为BCT研究带来可能 性。BCT数据的采集是主动行为和被动行为的结合,且“主 动”行为占主导地位。“被动行为”即研究者按研究计划定 期或不定期去采集的数据,时效性有限。而“主动行为”通过 一些穿戴设备,源源不断地向数据库中心传送数据。在阻塞 性睡眠呼吸暂停低通气综合征(obstructive sleep apnea-

hyrpopnea syfndi'ome,0SAHS)研究中,目前通过经皮血样饱和

度仪,采集患者睡眠期间实时氧饱和数据上传至数据中心, 方便研究人员根据数据来监测某种治疗措施,例如采用无创 呼吸机参数设置是否合适,患者配合是否满意来判断临床疗 效[7]。

成熟的临床数据库也为呼吸系统疾病,特别是呼吸危重 症研究带来了契机。MIMIC-II数据库全称为重症监护多参 数智能监测数据库 II ( multiparameter intelligent monitoring in

intensive care n database)。该数据库是对公众开放的免费

数据库,主要用于重症医学的各种临床研究。MIMIC-I包含 的信息有人口学特征、实验室检查、液体及药物医嘱、病历信 息和护理记录。另外一大块内容包括高精度的波形记录,如 心电监护、呼吸波形监护、血压、指测血氧饱和度等。通过注 册申请成功后就可以对全部数据下载,根据自己感兴趣的研 究内容展开研究分析[8]。在肺癌研究方面,美国癌症研究所 建立的SEER数据库,美国国立癌症数据库(national cancer

database,NCDB)储存了大量的肺癌患者数据,包括患者的

注册编号、个人信息、原发病灶部位、肿瘤尺寸、治疗方案、死 亡原因等信息,随着数据库数据量增大、信息量丰富,利用这 些数据库进行的大数据分析越来越多[9]。除了这种开放的 成熟数据库,尝试利用医院自身的病历系统进行大数据研究 亦是未来发展趋势。

然而,目前绝大多数医院尚未建立起有效的信息化支撑 体系,未能利用好医院临床信息系统已存在的大量临床数 据。临床研究的数据采集与医院临床信息系统割裂,特别是 不同医院之间临床信息系统录人格式没有统一化,尚难以共 享多家医疗机构资源来满足临床研究需求。此外,临床数据

内科临床实际问题的能力,同时具有跟踪呼吸病学科前沿, 将呼吸病学基础科研与临床紧密结合,具有转化医学头脑的 复合型医疗科技人才。然而,目前呼吸专业学位研究生培养 仍存在较多问题,不是“重临床,轻科研”就是“重科研、轻临 床”,难以在基础科研和临床工作两者之间找到“平衡点”。 大数据临床研究解决了呼吸专业学位研究生临床和科研孰 重孰轻的问题,并可将两者结合起来,使呼吸专业学位研究 生的研究课题立足于临床,通过大数据挖掘,解决临床问题, 满足了呼吸专业学位研究生的培养目标。因此,研究生导师 树立并引导专业学位研究生大数据临床科研的思维能力,对 于专业学位研究生的培养过程至关重要。

1.

树立重视全局的科研思维方式:重视全局的思维

式一方面体现在关注单个个体的全程数据,例如储存C0PD 单个患者自诊断以来所有数据,包括初次及后续肺功能检查 结果,用药情况,急性加重次数,因为一些看似不相关,不被 关注的指标最终可能会被纳人BCT的研究中。另外一方面 关注个体的人群,追求全集,这里提及的是“个体”,而不是 “患者”,例如在进行大气污染如雾霾、PM2.5和有毒有害气 体与呼吸道疾病相关性的研究中,针对的就是某个地区的所 有人群,随访采集多年,使用大数据的研究方法,从大量的数 据中挖掘、寻找大气污染与呼吸系统发病的相关因素。

2.

改变由因到果推导的科研思维模式:在大数据时代

不必非得知道现象背后的原因,而是要让数据自己“发声”。 在小数据世界中,相关关系也是有的,但在大数据的背景下, 相关关系大放异彩。通过应用相关关系,可以比以前更容 易、更快捷、更清楚地分析事物。结合临床研究具体来说,在 以往的RCT临床研究中,我们一般先假设一种想法,然后才 设计临床实验,收集相关数据来测试这个想法的可行性。这 就意味着我们最初的设计“因”影响甚至决定“果”。举一个 肺癌领域研究中非常有名的靶向药物“吉非替尼”的临床研 究,“吉非替尼”在2003年获得用于含铕两药和多西他赛化 疗后疾病进展的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,

NSCLC)患者治疗的快速审批资格,但此后因临床试验未证

实其疗效而被撤,实际上当时并不知道该药只对表皮生长因 子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变患者有 效,在研究设计之初未纳人的患者没有检测EGFR基因是否 存在突变,最终导致药物被撤[10]。但随后的IPASS研究、

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INFORM研究均选择EGFR基因激活突变患者人组并证实

历、各类数据库、网络资源等“大数据,’,培养呼吸内科专业学 位研究生临床科研思维,提高本专业临床科研质量。

参考文献

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networks for sternness and carcinogenic mechanisms,and cancer drug design using big database mining and genome-wide next-generation sequencing data[J]. Cell Cycle,2016, 15( 19) : 2593-2607.

“吉非替尼,’有效[11]。2015年“吉非替尼,’最终被美国FDA 批准为具有EGFR基因激活突变非小细胞肺癌患者的一线 用药[12]。由此可见,RCT这种“先人为主,’式的假设可以干 预甚至决定临床实验的成败。

在大数据时代,建立在人的主观判断基础上的预设关联 已经不再可行,因为数据库太大而且需要考虑的领域太复 杂,而且随着数据库的扩大及人工智能系统成熟,不再需要 人工设定一个关联,不再需要建立在假设的基础上,由事物 的相关性分析取代事物的因果分析,在BCT文章中,不会再 出现A和B方案的比较或限定小部分人群,而是把所有的可 能性都纳人,找出相关性最强的,希望得到哪种方案对哪些 人群有效。例如上述“吉非替尼,’治疗肺癌的临床研究,如果

样本量够大,计算机数据分析能力足够,亚组分析合理,很有 可能在早期的临床研究中就发现“吉非替尼,’对EGFR突变 非小细胞肺癌患者有效,避免假阴性结果的发布。

3.兼顾BCT和RCT的思维模式:如前所述,是不是BCT 就可以取代RCT 了呢?从本质上来说,BCT属于观察性研 究,因此必然存在观察性研究的缺陷,比如存在较多偏倚、基 线资料难以均衡以及混杂因素难以控制等。我们必须承认, 并不是所有的临床问题都需要并且能够通过大数据的方法 得到正确的结论,主要是因为:①并非所有研究都需要BCT 的方法验证,RCT在部分研究中通过抽样已经能给出很好的 答案,没有必要再去进行BCT研究;②虽然数据量目前已经 飞速发展,但样本量还不足够大,BCT研究也只能部分还原 真实世界,仍然面临存在偏倚甚至错误;③大数据统计学解 决方案还不够完善,对于某些复杂数据仍不能合理分析并给 出解决方案。因此,目前的临床研究还离不开RCT,兼顾

RCT和BCT进行临床研究,各取所长,在具体情况下具体分

10吕洋,苗立云.非小细胞肺癌分子靶向药物耐药机制的研究进

展[J/CD].中华肺部疾病杂志(电子版),2015,8( 1):82-84.11 Wu YL, Fukuoka M, Mok TS, et al. Tumor response and health-

related quality of life in clinically selected patients from asia with advanced non-small-cell lung cancer treated with first-line gefitinib: post hoc analyses from the ipass study [J]. Lung Cancer,2013,81

(2) : 280-287.

12 Greenhalgh J, Dwan K, Boland A, et al. First-line treatment of

advanced epidermal growth factor receptor ( EGFR ) mutation positive non-squamous non-small cell lung cancer [ J ] . Cochrane Database Syst Rev,2016,(5): CD010383.

析,才能选择到合适的研究方法。

总之,大数据时代的来临,必将对临床研究的理念和方 法产生重要的影响,基于大数据的数据收集、分析方法适用 于呼吸内科相关疾病的临床研究。呼吸内科研究生导师在 指导专业学位研究生科研选题中,应该充分利用大数据时代 带来的机遇,改变临床科研理念,与时俱进,充分利用电子病

(收稿日期:2017-07-05)(本文编辑:张大春)

徐瑜,刘煜亮,李琦.呼吸内科专业学位研究生“大数据”临床科研思维的培养[J/CD].中华肺部疾病杂志(电子版), 2017, 10(5): 634-636.

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