法律分析：公司把员工身份证拿到备案是为了以防公司之后发生什么和你有关的不好的事情，会在你的档案上留下一笔。如果没什么违法的事情是不会有什么影响的。
法律依据：《中华人民共和国身份证法》 第十五条
任何组织或者个人不得扣押居民身份证。
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第十六条
有下列行为之一的，由机关给予警告，并处二百元以下罚款，有违法所得的，没收违法所得：
1、使用虚明材料骗领居民身份证的；
2、出租、出借、转让居民身份证的；
3、非法扣押他人居民身份证的。
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