对于什么的案件上级机关可以直接办理或者指定管辖

违法行为人居住地机关管辖，但是涉及卖淫、嫖娼、、毒品的案件除外。移交违法行为人居住地机关管辖的行政案件，违法行为地机关在移交前应当及时收集证据，并配合违法行为人居住地机关开展调查取证工作。几个机关都有权管辖的行政案件，由最初受理的机关管辖。必要时，可以由主要违法行为地机关管辖。对管辖权发生争议的，报请共同的上级机关指定管辖。
一、什么情形行政案件由上级机关指定管辖
1、行政案件指定管辖的情形如下：
(1)对管辖权发生争议的，报请共同的上级机关指定管辖。
(2)对于重大、复杂的案件，上级机关可以直接办理或者指定管辖。
(3)上级机关直接办理或者指定管辖的，应当书面通知被指定管辖的机关和其他有关的机关。
(4)原受理案件的机关自收到上级机关书面通知之日起不再行使管辖权，并立即将案卷材料移送被指定管辖的机关或者办理的上级机关，及时书面通知当事人。
二、行政诉讼管辖的规定有哪些
1、行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民管辖。
2、经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民管辖。
3、对人身自由的行政强制措施不服提起的诉讼，由被告所在地或者原告所在地人民管辖。
4、因不动产提起的行政诉讼，由不动产所在地人民管辖。
5、两个以上人民都有管辖权的案件，原告可以选择其中一个人民提起诉讼。原告向两个以上有管辖权的人民提起诉讼的，由最先立案的人民管辖。
6、移送管辖人民发现受理的案件不属于本院管辖的，应当移送有管辖权的人民，受移送的人民应当受理。受移送的人民认为受移送的案件按照规定不属于本院管辖的，应当报请上级人民指定管辖，不得再自行移送。

法律依据：

《机关办理行政案件程序规定》 第十五条 对管辖权发生争议的，报请共同的上级机关指定管辖。对于重大、复杂的案件，上级机关可以直接办理或者指定管辖。上级机关直接办理或者指定管辖的，应当书面通知被指定管辖的机关和其他有关的机关。