企业法人营业执照上标注为有限公司(自然人独资)的经济类型明确为私营经济。这种类型的公司是由单一自然人投资者设立的有限责任公司，不属于国有、集体、联营、股份制、外资或港澳台投资等其他经济类别。个体经济与之不同，它指的是个体工商户和个人合伙，这些都不具备公司的法人属性。
根据《中华人民共和国公司法》的规定，一人有限责任公司的设立和组织结构遵循特定条款。例如，一人只能设立一个此类公司，且在公司登记中需明确标明自然人独资，公司章程由股东制定，且公司需年度审计以保证财务透明度。如果股东不能证明公司财产与个人财产，股东需对公司债务承担连带责任。
总结来说，有限公司(自然人独资)的经济性质是私营，受到相关法律法规的严格管理和监管，以确保其经营的性和公平性。
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